MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile 630

Total Repeats: 25224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009089	T	7	7	1368	1374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009089	ATT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009089	TTA	2	6	1473	1478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009089	CAA	2	6	1486	1491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009089	CTA	3	9	1495	1503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009089	TAC	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009089	TA	4	8	1530	1537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009089	AGG	2	6	1547	1552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009089	AGG	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009089	A	7	7	10639	10645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009089	A	6	6	10692	10697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009089	AAAC	2	8	10757	10764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009089	GGC	2	6	10851	10856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009089	GCG	2	6	10899	10904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009089	AC	3	6	10939	10944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009089	ATA	2	6	10977	10982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009089	GGTAA	2	10	11054	11063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009089	CGA	2	6	11077	11082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009089	GCA	2	6	11151	11156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009089	GCA	2	6	11191	11196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009089	CGC	2	6	11198	11203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009089	GTGA	2	8	11204	11211	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009089	GAG	2	6	11266	11271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009089	CAG	2	6	11294	11299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009089	GTA	2	6	11400	11405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009089	AGGAG	2	10	11434	11443	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009089	AGG	2	6	11483	11488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009089	GGC	2	6	11504	11509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009089	GAA	2	6	11746	11751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009089	GGT	2	6	11822	11827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009089	GTC	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009089	TCGTG	2	10	11845	11854	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009089	CAT	2	6	11904	11909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009089	AG	3	6	11925	11930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009089	GGA	2	6	11948	11953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009089	ATC	2	6	11972	11977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009089	AC	3	6	11999	12004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009089	GTA	2	6	12017	12022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009089	TGC	2	6	12138	12143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009089	AC	3	6	12168	12173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009089	CAC	2	6	12183	12188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009089	GAA	2	6	12229	12234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009089	GTC	2	6	12235	12240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009089	CCT	2	6	12309	12314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009089	CTTGC	2	10	12398	12407	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009089	CTC	2	6	12432	12437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009089	CCA	2	6	12442	12447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009089	TAG	2	6	12482	12487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009089	GTTT	2	8	12574	12581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009089	AAT	2	6	12615	12620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009089	GTT	2	6	12637	12642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009089	GTG	2	6	12650	12655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009089	AT	4	8	12720	12727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009089	AT	3	6	12753	12758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009089	TTA	2	6	12830	12835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009089	GAAG	2	8	13034	13041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009089	AGAA	2	8	13042	13049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009089	GCG	2	6	13067	13072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009089	CAC	2	6	13173	13178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009089	AGG	2	6	13264	13269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009089	ACC	2	6	13271	13276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009089	TAC	2	6	13290	13295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009089	GGGAG	2	10	13346	13355	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009089	TG	3	6	13406	13411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009089	GA	3	6	13706	13711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009089	TAAGT	2	10	13871	13880	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009089	AGC	2	6	13927	13932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009089	TAC	2	6	14005	14010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009089	ATG	2	6	14030	14035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009089	ACA	2	6	14230	14235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009089	TAC	2	6	14250	14255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009089	GA	3	6	14268	14273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009089	TAAGC	2	10	14292	14301	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009089	TG	3	6	14315	14320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009089	TAG	2	6	14392	14397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009089	GGTG	2	8	14472	14479	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009089	GA	3	6	14502	14507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009089	TGT	2	6	14510	14515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009089	CCA	2	6	14561	14566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009089	CGG	2	6	14726	14731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009089	CAA	2	6	14820	14825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009089	TAC	2	6	14926	14931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009089	ACC	2	6	14997	15002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_009089	GTA	2	6	15006	15011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009089	TC	3	6	15117	15122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009089	CGTA	2	8	15138	15145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009089	AG	3	6	15161	15166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009089	GGT	2	6	15221	15226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009089	TCA	2	6	15336	15341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009089	GTA	2	6	15354	15359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009089	CGT	2	6	15416	15421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009089	AAGAT	2	10	15600	15609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009089	GCA	2	6	15671	15676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009089	ATTT	2	8	15722	15729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009089	TTCA	2	8	15734	15741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009089	AT	3	6	15747	15752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009089	TTA	2	6	15809	15814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009089	AG	3	6	15863	15868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009089	CT	3	6	15905	15910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009089	TGG	2	6	15926	15931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009089	T	7	7	15969	15975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009089	TAT	2	6	15979	15984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009089	TAA	2	6	16027	16032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009089	TA	3	6	16048	16053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009089	TTAA	2	8	17498	17505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009089	A	6	6	17510	17515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009089	A	6	6	17528	17533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009089	A	7	7	17548	17554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009089	AAT	2	6	17559	17564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009089	AT	4	8	17582	17589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009089	A	6	6	17645	17650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009089	T	7	7	17845	17851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009089	TAT	2	6	17923	17928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009089	ATT	2	6	17933	17938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009089	AGG	2	6	17939	17944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009089	TGA	2	6	19256	19261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009089	AT	3	6	19267	19272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009089	AATA	2	8	19284	19291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009089	A	7	7	19291	19297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009089	ATT	2	6	19305	19310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009089	T	7	7	19330	19336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009089	CAG	2	6	19350	19355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009089	TCA	2	6	19361	19366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009089	ATT	2	6	19415	19420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009089	A	8	8	19434	19441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009089	TA	4	8	19448	19455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009089	TAA	2	6	19457	19462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009089	TAAA	2	8	19464	19471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009089	AAAAT	2	10	19473	19482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009089	GATAA	2	10	19508	19517	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009089	GGA	2	6	19535	19540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009089	GA	3	6	20001	20006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009089	CT	3	6	20080	20085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009089	GCC	2	6	20218	20223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009089	GTG	2	6	20232	20237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009089	GGAA	2	8	20287	20294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009089	TG	3	6	20316	20321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009089	AT	3	6	20400	20405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009089	T	7	7	20435	20441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009089	AG	3	6	20456	20461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009089	TAT	2	6	22116	22121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009089	ATA	3	9	22125	22133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009089	AGG	2	6	22150	22155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009089	T	6	6	23159	23164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009089	GATTTA	2	12	23187	23198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009089	TCT	2	6	23210	23215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009089	TGT	2	6	23229	23234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_009089	ATTTA	2	10	32935	32944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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